Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms