Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc180J3QNE4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms