Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem185aA2AF53 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms