Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf6Q9DBU5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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