Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim32Q8CH72 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim32Q8CH72 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim32Q8CH72 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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