Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trappc6aQ78XR0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trappc6aQ78XR0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trappc6aQ78XR0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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