Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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