Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AlkP97793 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AlkP97793 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AlkP97793 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AlkP97793 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms