Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms