Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms