Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18528 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms