Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01788 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01788 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01788 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01788 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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