Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop5Q9DB28 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms