Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms