Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ubash3bQ8BGG7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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