Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms