Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nop58Q6DFW4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms