Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccne1Q61457 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccne1Q61457 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccne1Q61457 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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