Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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