Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms