Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms