Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAPAQ9P0L0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms