Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms