Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul7Q8VE73 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms