Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fam208bQ5DTT3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fam208bQ5DTT3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fam208bQ5DTT3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fam208bQ5DTT3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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