Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yy1Q00899 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Yy1Q00899 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms