Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CgnP59242 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CgnP59242 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms