Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms