Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFTRP13569 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFTRP13569 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFTRP13569 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CFTRP13569 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CFTRP13569 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CFTRP13569 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CFTRP13569 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFTRP13569 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFTRP13569 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFTRP13569 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms