Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms