Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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