Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms