Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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