Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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