Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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