Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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