Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKD1P98161 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKD1P98161 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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