Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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