Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BACE1P56817 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms