Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms