Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms