Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MsmbO08540 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MsmbO08540 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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MsmbO08540 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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