Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20815J3KMI0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms