Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r25W4VSP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r25W4VSP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms