Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top3bQ9Z321 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms