Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer1Q9Z2Y3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer1Q9Z2Y3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms