Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt85Q9Z2T6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt85Q9Z2T6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt85Q9Z2T6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms