Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crlf3Q9Z2L7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crlf3Q9Z2L7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms