Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd4Q9Z2D7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd4Q9Z2D7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms