Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rps6ka4Q9Z2B9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rps6ka4Q9Z2B9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms